Missing coverage evidence...
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TTGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGC  >  W3110S.gb/170821‑170885                                                                 | ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTTTGGTCTGGTCGGc  <  1:2716164/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCTGc  <  1:504584/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2599299/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:864325/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:772150/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:667908/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:596961/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:492141/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:3108633/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2999350/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:299546/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2894433/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2708608/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2682487/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2646294/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1156472/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2543863/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2479459/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2425857/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2307068/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2162191/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2089809/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2084507/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2030468/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1917418/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1904159/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1490567/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1415197/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1234137/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:1182322/65‑1 (MQ=255) ttGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTCGTCGGc  <  1:2637026/65‑1 (MQ=255)    cgcACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGc  <  1:2091530/62‑1 (MQ=255)                                                                 | TTGCGCACAGAACCTAACCTTGAACTGCTGACCGAAATGAAACCATCGTTTATGGTCTGGTCGGC  >  W3110S.gb/170821‑170885

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑