Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	587744	587747	4	16 [0]	[0] 21	nfrA	bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit

CACCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCCAGCA  >  W3110S.gb/587748‑587812 |                                                                 caCCCCGTTTTCTCCGGTATTGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:3005050/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:2071445/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:945526/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:783001/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:726597/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:453442/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:401862/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:3090538/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:2953487/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:2670926/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:2223879/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1145294/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1992985/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1824584/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1753684/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1723219/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1648298/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1488827/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1383643/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCcagca  <  1:1331128/65‑1 (MQ=255) caCCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGGCGCCTTCcagca  <  1:145041/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CACCCCGTTTTCTCCGGTATCGGCAAAGACGCGGCTATAAACTGAGAGCAGGTCGCCTTCCAGCA  >  W3110S.gb/587748‑587812

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑