Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1131530	1131591	62	13 [0]	[0] 8	flgM	anti‑sigma factor for FliA (sigma 28)

GCTGGTGGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTCGCGCG  >  W3110S.gb/1131592‑1131656 |                                                                 gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:1082486/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:1581622/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:1683549/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:2176965/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:2632863/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:3006460/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:681161/65‑1 (MQ=255) gctggtgGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTcgcgcg  <  1:820735/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCTGGTGGAGGCGGTTGTTTTTGCCGCCCGGCTGTTCGTTACCGGCGCGTCAGTGGTTTCGCGCG  >  W3110S.gb/1131592‑1131656

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑