Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1140292	1140430	139	3 [0]	[0] 11	flgK	flagellar hook‑filament junction protein 1

TATCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACG  >  W3110S.gb/1140431‑1140495 |                                                                 tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:1485762/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:1775512/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:2204908/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:2205401/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:2770271/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:2949589/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:3012010/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:419215/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:636522/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:86960/65‑1 (MQ=255) tatCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACg  <  1:902622/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TATCGCGATAGGTGCCAGCGTTGATCAGATCAACAACTACGCTAAACAAATTGCCAGCCTGAACG  >  W3110S.gb/1140431‑1140495

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑