Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1463673	1463693	21	2 [0]	[0] 32	paaJ	predicted beta‑ketoadipyl CoA thiolase

GTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGC  >  W3110S.gb/1463694‑1463758 |                                                                 gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACg                   >  1:2950012/1‑48 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2408377/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:99702/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:808617/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:63261/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:60766/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:557183/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:504403/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:496703/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:415841/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2870145/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2710766/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2663067/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2660413/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2438529/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1012570/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2330862/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2309468/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2157600/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2103818/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:2052101/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1761364/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:168583/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1597345/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1564848/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1551008/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1399554/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1340698/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1294100/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1276808/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGc  >  1:1049936/1‑65 (MQ=255) gtgCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTCTGc  >  1:925962/1‑65 (MQ=255) |                                                                 GTGCCCGCCTGGCACTGGCTGCCAGCCATGAGCTGCATCGGCGTAACGGTCGTTACGCATTGTGC  >  W3110S.gb/1463694‑1463758

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑