Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2004116	2004196	81	5 [0]	[0] 10	fliA/fliC	RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor/flagellar filament structural protein

ATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAG  >  W3110S.gb/2004197‑2004261 |                                                                 aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1031154/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:1590830/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:2362729/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:2442380/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:2571618/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:2779305/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:397066/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:583238/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:875269/65‑1 (MQ=255) aTCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTATCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGcagcag  <  1:2068834/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTAATCAGGTTACAACGATTAACCCTGCAGCAG  >  W3110S.gb/2004197‑2004261

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑