Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2004358	2004409	52	11 [0]	[0] 16	fliC	flagellar filament structural protein

GTGTTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAGG  >  W3110S.gb/2004410‑2004463 |                                                      gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:129837/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:1350379/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:14489/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:1541106/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:1865917/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:1884976/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:2112603/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:2169914/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:2554765/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:397951/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:522299/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:551749/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:69028/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:833243/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:871634/54‑1 (MQ=255) gtgtTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAgg  <  1:887777/54‑1 (MQ=255) |                                                      GTGTTGTTCAGGTTGGTAACCGCGGAATCCAGACGGTTTTGCACCGCACCGAGG  >  W3110S.gb/2004410‑2004463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑