Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2018584	2018588	5	52 [0]	[0] 25	fliH	flagellar biosynthesis protein

TCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTGG  >  W3110S.gb/2018589‑2018652 |                                                                tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2123376/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:732099/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:65292/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:342883/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2977223/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2916776/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2913202/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:285922/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2741085/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2596033/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2579017/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2525319/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1009385/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2009160/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1989230/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1803132/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1655262/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1447449/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1333551/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1291709/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1280703/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:106409/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1013071/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGAGCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:1048591/64‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGCTGTAAAGGCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTgg  <  1:2972073/64‑1 (MQ=255) |                                                                TCCTGGCGGCTGTAAAGTCTCCGCCGATGAAGGCGATCTCGACGCCAGTGTCGCCACTCGCTGG  >  W3110S.gb/2018589‑2018652

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑