Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2553403	2553445	43	2 [1]	[0] 8	murP	fused predicted enzyme IIBC components of PTS

CGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACG  >  W3110S.gb/2553446‑2553510 |                                                                 cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTcaccac   >  1:2230265/1‑64 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:157759/1‑65 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:2067575/1‑65 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:2744758/1‑65 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:2827042/1‑65 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:2889376/1‑65 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:347179/1‑65 (MQ=255) cGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACg  >  1:879454/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGGCCATGGCGGTTTATGCTGGCGGGATTCTGGTGGCATGGGTTTGCGGGTTTATTTTCACCACG  >  W3110S.gb/2553446‑2553510

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑