Missing coverage evidence...
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CCCTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTG  >  W3110S.gb/2638872‑2638935 |                                                                cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACcaca                   >  1:2484523/1‑47 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2924553/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2102603/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:212194/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2223056/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2464272/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2530131/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2889024/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2899772/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2052791/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2983415/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:3025994/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:497726/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:55542/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:713041/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:815207/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:947590/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1001975/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:2012673/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1971746/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1927725/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1927353/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1905702/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1831135/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:168658/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1477804/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1391639/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:136900/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1362349/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1262136/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:122176/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:1130090/1‑64 (MQ=255) cccTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTg  >  1:108712/1‑64 (MQ=255) |                                                                CCCTTTCTGCGGACGCTCGTGACGGAACATCGGCCCGATATACCACAGACGCTGTTCCTGATTG  >  W3110S.gb/2638872‑2638935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑