Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2667241	2667242	2	9 [0]	[0] 12	hcaR	DNA‑binding transcriptional regulator

AATTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGC  >  W3110S.gb/2667243‑2667307 |                                                                 aattcaattcCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2057968/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:1554023/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:1728095/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:1857216/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:1917435/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:1940063/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2009598/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2107055/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2624350/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2729496/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2801466/1‑65 (MQ=255) aaTTCACTTCCGCCGATAGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCcgc  >  1:2208393/1‑65 (MQ=255) |                                                                 AATTCACTTCCGCCGATGGCACAAAGCCAATGGTTAATTGTCTGTCTTCCTGAACAATTTTCCGC  >  W3110S.gb/2667243‑2667307

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑