Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3114303	3114304	2	20 [1]	[0] 21	yghJ	predicted inner membrane lipoprotein

TAAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGT  >  W3110S.gb/3114305‑3114362 |                                                          taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCagagact  <  1:2365307/58‑3 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2749789/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:945040/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:839607/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:70674/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:608165/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:39520/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2950838/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2933197/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2841001/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2795983/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:1511118/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:261930/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:257759/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:257551/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2458086/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:2244648/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:1866008/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:166931/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:1602126/58‑1 (MQ=255) taAATCAGGCCACC‑TAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGt  <  1:515364/57‑1 (MQ=255) |                                                          TAAATCAGGCCACCGTAAGGCACCTTGAACTTCACCGTACCGCTAGCGTCCAGAGAGT  >  W3110S.gb/3114305‑3114362

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑