Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3213488	3213555	68	11 [0]	[0] 13	[rpoD]	[rpoD]

GATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGTT  >  W3110S.gb/3213556‑3213620 |                                                                 gATCAGGCTTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:2335622/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:1158916/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:1219781/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:1341969/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:1510021/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:1652367/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:1992600/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:2675861/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:414795/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:511477/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:55871/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:715463/65‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGtt  <  1:761503/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GATCAGGCGTTACGCCGCACCCGGCACTAGGCCCTCTGCACAAACGCCACCTTTTCGGTGGCGTT  >  W3110S.gb/3213556‑3213620

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑