Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3531488	3531499	12	6 [0]	[0] 13	cpxR	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with CpxA

CTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAGT  >  W3110S.gb/3531500‑3531564 |                                                                 cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1006226/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1104437/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1537832/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1628806/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1739684/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1802806/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:1942560/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:2275699/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:2433057/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:2607775/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:2863304/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:2965377/1‑65 (MQ=255) cTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAgt  >  1:759861/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CTGCTCTATTTGCTGGCACAGCATCTGGGTCAGGTGGTTTCCCGTGAACATTTAAGCCAGGAAGT  >  W3110S.gb/3531500‑3531564

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑