Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3618284	3618333	50	2 [0]	[0] 34	rmuC	predicted recombination limiting protein

TGTTTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCAA  >  W3110S.gb/3618334‑3618399 |                                                                  tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGt                             >  1:2597580/1‑39 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGt                             >  1:25705/1‑39 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCa                           >  1:885387/1‑41 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTaaaa              >  1:2953566/1‑54 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGtt     >  1:1513798/1‑63 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTc    >  1:1639141/1‑64 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTc    >  1:2956078/1‑64 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTc    >  1:284988/1‑64 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTc    >  1:2777375/1‑64 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1175906/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:739880/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:600145/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:569832/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:462917/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:3101305/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2992380/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2781229/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2691055/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:261580/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1297981/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1463319/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2475498/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2417812/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2417810/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2256977/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2060424/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:2011306/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1931692/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1776291/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1769124/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1678649/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCa   >  1:1655485/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGGTCa   >  1:2960861/1‑65 (MQ=255) tgttTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCT‑CGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCaa  >  1:374637/1‑65 (MQ=255) |                                                                  TGTTTTTCAACGCTTCGGTGATCAGCTCCGGCTGGCGGTCAAGCGCCAGTAAAAAAGCGGGTTCAA  >  W3110S.gb/3618334‑3618399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑