Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4124321	4124326	6	20 [0]	[0] 36	damX	hypothetical protein

TTGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATC  >  W3110S.gb/4124327‑4124390 |                                                                ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1131090/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:2105706/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1928790/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1858039/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:2990713/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1597625/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1270751/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1142756/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGa    <  1:1138297/62‑1 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGAt   >  1:1246849/1‑63 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGAt   >  1:2881190/1‑63 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:489711/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:42192/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:403081/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:38584/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1079905/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:293101/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:2862798/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:285910/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:2531034/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:2254349/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:77096/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:2225646/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:2023631/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1976516/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1964712/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1915303/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1911497/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1715138/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:149770/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1456816/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1356421/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATc  >  1:1171994/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAAGTACAGGCCGATc  >  1:1950528/1‑64 (MQ=255) ttGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACAGc                       >  1:2547863/1‑43 (MQ=255) ttGCCAGAAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAAc                          >  1:1727259/1‑40 (MQ=255) |                                                                TTGCCAGCAGATGTCCAGGCCAAAAACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATC  >  W3110S.gb/4124327‑4124390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑