Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	153558	153560	3	14 [0]	[0] 24	htrE	predicted outer membrane usher protein

GTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTATTT  >  W3110S.gb/153561‑153625 |                                                                 gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2466576/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:765482/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:665871/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:541604/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:499948/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:355026/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:305337/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2873115/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2750349/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2695621/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2519278/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2507288/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1159648/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2433574/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2365088/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2071204/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:2065525/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1639507/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1581562/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1407851/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1249036/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1193174/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTAttt  <  1:1173719/65‑1 (MQ=255) gTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGATTAttt  <  1:2429745/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GTTATCGCTATAGCCACTGCTGCTAACGTTGAGTTGGTTATTACCCTTAAAGTCACTGCTTATTT  >  W3110S.gb/153561‑153625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑