Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	199377	199398	22	4 [0]	[0] 9	yaeT	conserved hypothetical protein

ATAATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAG  >  W3110S.gb/199399‑199461 |                                                               ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTTTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:338989/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:1104052/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:1113601/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:1624729/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:2291729/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:3090990/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:500076/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:643103/63‑1 (MQ=255) ataATGACTTCCAGGCAGATGACGCAGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAg  <  1:467602/63‑1 (MQ=255) |                                                               ATAATGACTTCCAGGCAGATGACGCCGACCTGTCCGACTATACCAACAAGAGTTATGGTACAG  >  W3110S.gb/199399‑199461

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑