Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	249419	249419	1	2 [0]	[0] 7	fhiA	ECK0230:JW5811:b0229; flagellar system protein, promoterless fragment

GGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTG  >  W3110S.gb/249420‑249483 |                                                                ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:1125786/64‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:1244620/64‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:1940640/64‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:581143/64‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:768496/64‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:796144/64‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCACCGCCGCCAGCGGCTGTTTg  <  1:1410697/64‑1 (MQ=255) |                                                                GGTGATGGTGCGGGTCAGCGTTTCGAGGCTTTTCTCTTCCGCCTCCGCCGCCAGCGGCTGTTTG  >  W3110S.gb/249420‑249483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑