| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 978,819 | 0 | A | T | 61.2% | 37.1 / 58.1 | 49 | D691V (GAC→GTC) | mukB | fused chromosome partitioning proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/19); new base T (0/30); total (0/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATC > W3110S.gb/978765‑978883 | gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:2351309/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:295049/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:1937798/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:2062390/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:1764502/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:529772/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:1436522/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:738169/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:1161387/65‑1 (MQ=255)gTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:116137/65‑1 (MQ=255) tCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:2527048/64‑1 (MQ=255) tCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGc < 1:2906017/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCGGTACTTCTCAgc < 1:2773784/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2669220/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2703565/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2723472/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1099838/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2353801/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:449667/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:3061059/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:39777/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2370162/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:538452/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:60202/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:713496/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:773187/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:797892/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:822816/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:829805/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:933657/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1956839/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2294391/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2333134/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1930434/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1402499/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1403841/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1722103/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2219510/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2206708/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1663441/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1434466/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2196961/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2026171/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2758032/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1309283/64‑1 (MQ=255) gtggtgTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:235518/64‑1 (MQ=255) tgctgcTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:1477702/58‑1 (MQ=255) ctgctgTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:2068168/56‑1 (MQ=255) aTGTCGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAgc < 1:326175/40‑1 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:1419382/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:1138620/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:758780/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:141906/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2019683/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:3016280/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:292542/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2925017/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2049701/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2894524/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2718451/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2548719/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2542453/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2292134/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2489179/1‑65 (MQ=255) acgacgTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATc > 1:2442367/1‑65 (MQ=255) | GTCTGAACGCGCTGGCGGAGCGTTTTGGTGGTGTGCTGCTGTCAGAAATTTATGACGACGTTAGCCTGGAAGATGCGCCGTACTTCTCAGCGCTGTATGGCCCGTCACGCCACGCCATC > W3110S.gb/978765‑978883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |