| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 3,018,630 | G→A | D272N (GAC→AAC) | ssnA → | predicted chlorohydrolase/aminohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 3,018,630 | 0 | G | A | 98.8% | 279.1 / ‑3.3 | 82 | coding (814/1329 nt) | ssnA | predicted chlorohydrolase/aminohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (18/63); minor base . (1/0); total (19/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
GCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATGACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATG > W3110S.gb/3018596‑3018689 | gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTATTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1041712/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2705168/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1734170/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1790080/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1947599/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1982634/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2056593/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2385920/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2406998/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2520246/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2615412/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1001358/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2838519/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:817321/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2943191/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:410201/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:564784/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:656432/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:74089/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1574759/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:1286116/65‑1 (MQ=255)gCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCCCGATGCGt < 1:1953310/65‑1 (MQ=255) ggTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGt < 1:2207589/62‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1162266/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:961062/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2570779/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1291256/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2649480/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2747700/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2791605/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2862048/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2880022/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1622874/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1081483/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2979675/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:3030538/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:359185/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1071398/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:621216/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:629931/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:662635/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:890419/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:176887/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1933416/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:156266/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1607455/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:152676/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:907959/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1424651/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1631684/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:219974/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2356571/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:2341224/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1420453/65‑1 (MQ=255) gCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:1617979/65‑1 (MQ=255) ccTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:104691/64‑1 (MQ=255) cTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGt < 1:451924/64‑1 (MQ=255) cTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGAGGCGTTCCTGGt < 1:2372853/64‑1 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:1049438/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:528958/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:462857/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:613487/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:1846375/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:3073150/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:1410683/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:258550/1‑65 (MQ=255) gTACTTGTCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGccc > 1:850834/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGc > 1:2450748/1‑49 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:814031/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:373514/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:1975182/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:127271/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:2392284/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:2541799/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACTCAATCAG‑GCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAAc > 1:1002254/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGATAACATCACCCTACCCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCaaa > 1:1315329/1‑65 (MQ=255) tCGAAAGAT‑AAATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAAc > 1:577886/1‑65 (MQ=255) aaGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATg < 1:780714/65‑1 (MQ=255) aaGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATg < 1:2927308/65‑1 (MQ=255) aaGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATg < 1:264529/65‑1 (MQ=255) aaGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATg < 1:2414409/65‑1 (MQ=255) aaGATAACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATg < 1:1989123/65‑1 (MQ=255) | GCTGGTCGCTCATGGGCTGTACTTGTCGAAAGATGACATCACCCTACTCAATCAGCGCGATGCGTTCCTGGTGCATAACGCCCGTTCAAACATG > W3110S.gb/3018596‑3018689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |