Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,769,914 G→A A410T (GCC→ACC)  dgoT → D‑galactonate transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,769,9140GA100.0% 120.5 / NA 39A410T (GCC→ACC) dgoTD‑galactonate transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (27/12);  total (27/12)

CCTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCGCCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCCTG  >  W3110S.gb/3769868‑3769949
                                              |                                   
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:1533994/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:2089221/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:2354055/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:176008/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:2786462/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:1616961/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:608854/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:751341/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:788587/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:1394498/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:2565714/53‑1 (MQ=255)
ccTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcg                               <  1:117048/53‑1 (MQ=255)
      gcATGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:1106545/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTc                                >  1:1078252/1‑46 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGt                            >  1:273364/1‑50 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTgg                     >  1:2013739/1‑57 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGgcgcg                 >  1:2854571/1‑61 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGgcg                   >  1:765333/1‑59 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:2676545/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:910996/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:2847826/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:400479/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:606450/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:823613/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:1028471/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:2511133/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:1655265/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:1550172/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:149570/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:1343504/1‑65 (MQ=255)
      gcAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGctct             >  1:1054925/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTcgc                              >  1:2616784/1‑37 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCctg  >  1:2458976/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCctg  >  1:2076786/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCctg  >  1:207121/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCctg  >  1:1679237/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCctg  >  1:1517322/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCctg  >  1:837792/1‑65 (MQ=255)
                 gTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCACCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATActg  >  1:1480180/1‑65 (MQ=255)
                                              |                                   
CCTGGCGCAGGGTTACGGTTTCGCACCTGCACTGGTTTATATCTCCGCCGTCGCGTTGATTGGCGCGCTCTCTTATATCCTG  >  W3110S.gb/3769868‑3769949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: