Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 710,341 C→T P44S (CCA→TCA)  ybfN → predicted lipoprotein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb710,3410CT100.0% 168.9 / NA 51P44S (CCA→TCA) ybfNpredicted lipoprotein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (27/24);  total (27/24)

GCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGCCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTGAAGAAA  >  W3110S.gb/710305‑710388
                                    |                                               
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:491236/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:2851821/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:3020624/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:2728755/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:302994/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:260850/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:2539741/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:2528168/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:2369323/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:45226/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:485128/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:1782584/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:767032/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:1423535/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:1383584/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:1277454/65‑1 (MQ=255)
gCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:1209758/65‑1 (MQ=255)
 cATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGAgt                     <  1:398764/64‑1 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:999063/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:556778/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:690996/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:409338/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:842764/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:87102/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:1051708/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:2848032/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:1452861/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:2618745/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:2529308/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:1862098/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:1814763/1‑65 (MQ=255)
      aGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTaaa               >  1:1859344/1‑65 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:137196/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:91967/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:785844/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:1613624/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:646780/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:641583/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:1656364/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:2244717/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:2806253/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:2983288/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:294712/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:2920273/1‑64 (MQ=255)
                tCAACACCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTgaa      >  1:2870007/1‑64 (MQ=255)
                    cacCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGATCGTGTTAAACGTGCTGaagaaa  <  1:1487419/64‑1 (MQ=255)
                    cacCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTGaagaaa  <  1:471037/64‑1 (MQ=255)
                    cacCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTGaagaaa  <  1:1588577/64‑1 (MQ=255)
                    cacCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTGaagaaa  <  1:890687/64‑1 (MQ=255)
                    cacCGCACAAGGTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTGaagaaa  <  1:281678/64‑1 (MQ=255)
                              ggTTCGTCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCgt                     <  1:3100329/35‑1 (MQ=255)
                                    |                                               
GCATACAGCGCCTGTATCAACACCGCACAAGGTTCGCCAGAAAAAATTGAAGCCTGCCAGAGCGTGTTAAACGTGCTGAAGAAA  >  W3110S.gb/710305‑710388

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: