Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,352,814	G→A	intergenic (‑61/+307)	fabI ← / ← ycjD	enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,352,814	0	G	A	100.0%	52.3 / NA	17	intergenic (‑61/+307)	fabI/ycjD	enoyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase, NADH‑dependent/conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (9/8);  total (9/8)

TAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATA  >  W3110S.gb/1352753‑1352846                                                              |                                 tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:1052929/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:613173/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:540167/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:450023/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:2925212/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:2508425/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:225253/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:1850110/65‑1 (MQ=255) tAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTtaataa                               <  1:1822139/65‑1 (MQ=255)          tCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:61992/1‑64 (MQ=255)          tCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:2871465/1‑64 (MQ=255)          tCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:2991178/1‑64 (MQ=255)             ttATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:937960/1‑61 (MQ=255)             ttATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:907382/1‑61 (MQ=255)             ttATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:2398107/1‑61 (MQ=255)             ttATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:1260582/1‑61 (MQ=255)             ttATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:379539/1‑61 (MQ=255)             ttATTGTTGAAGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACg                       >  1:2149445/1‑61 (MQ=255)                         cTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGtta       <  1:3093492/65‑1 (MQ=255)                         cTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGtta       <  1:1328697/65‑1 (MQ=255)                         cTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGtta       <  1:1468581/65‑1 (MQ=255)                         cTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGtta       <  1:1605307/65‑1 (MQ=255)                         cTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGtta       <  1:2018091/65‑1 (MQ=255)                               gtgCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATtata  <  1:520409/64‑1 (MQ=255)                               gtgCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATtata  <  1:1012632/64‑1 (MQ=255)                               gtgCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAATAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATtata  <  1:1642637/64‑1 (MQ=255)                                                              |                                 TAGCTTTAATCCTTATTGTTGATGCTTGTTGTGCCTGAAAATCAGGCGATTCGTCGTTTTAGTAAACAGTACGAACAGATAAACGGTTATTATA  >  W3110S.gb/1352753‑1352846

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑