Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,482,053	A→G	D401G (GAT→GGT)	ynbC →	predicted hydrolase

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,482,053	0	A	G	97.1%	116.2 / ‑3.9	34	D401G (GAT→GGT)	ynbC	predicted hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/1);  new base G (33/0);  total (33/1)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01

AATACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGATCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACATTG  >  W3110S.gb/1482027‑1482094                           |                                          aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTGGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:1411330/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGTCa     >  1:2703366/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:2828084/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:979651/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:956306/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:90172/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:862509/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:674331/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:376184/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:326916/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:3096464/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:1004174/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:231089/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:1903578/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:1894049/1‑65 (MQ=255) aaTACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACa     >  1:1536110/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCCCGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1205741/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:364587/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1137948/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1227721/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:887891/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:733712/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1370730/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:535933/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1486615/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1983175/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:329031/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:1745025/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:2891610/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:24419/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAtt   >  1:2378880/1‑65 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACAt    >  1:830842/1‑64 (MQ=255)   tACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGGTCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCAGCGTGGTTGACAtt   >  1:2966257/1‑65 (MQ=255)    aCTGATTAAACAAGCCGTTGCCGATCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACATTg  <  1:1301077/65‑1 (MQ=255)                           |                                          AATACTGATTAAACAAGCCGTTGCCGATCTCCACGCCAAAGGTTTAGCCGTCCGCGTGGTTGACATTG  >  W3110S.gb/1482027‑1482094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑