Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,952,452	G→A	intergenic (‑216/‑94)	aspS ← / → yecD	aspartyl‑tRNA synthetase/predicted hydrolase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,952,452	0	G	A	100.0%	66.9 / NA	22	intergenic (‑216/‑94)	aspS/yecD	aspartyl‑tRNA synthetase/predicted hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (12/10);  total (12/10)

ATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGT  >  W3110S.gb/1952441‑1952512            |                                                             ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:1261285/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:992584/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:949733/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:720968/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:2351346/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:2144056/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:2143068/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:2092633/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:1996548/64‑1 (MQ=255) ataAAGGTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGc          <  1:1972158/64‑1 (MQ=255)      ggTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAg    >  1:1420683/1‑65 (MQ=255)      ggTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAg    >  1:2918987/1‑65 (MQ=255)      ggTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAg    >  1:2922691/1‑65 (MQ=255)      ggTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAg    >  1:2990884/1‑65 (MQ=255)      ggTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAg    >  1:3055371/1‑65 (MQ=255)      ggTGTTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAg    >  1:1385078/1‑65 (MQ=255)        tgtTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAgg   >  1:1317857/1‑64 (MQ=255)        tgtTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGgt  >  1:1880660/1‑65 (MQ=255)        tgtTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGgt  >  1:2592954/1‑65 (MQ=255)        tgtTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGgt  >  1:2778548/1‑65 (MQ=255)        tgtTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGgt  >  1:1081228/1‑65 (MQ=255)        tgtTACCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCAATCGGCTAATCGCATTAAGgt  >  1:2314144/1‑65 (MQ=255)            |                                                             ATAAAGGTGTTGCCCGAACTCATAAAAATTAACAAAATTTGTCGTTCCGCCATCGGCTAATCGCATTAAGGT  >  W3110S.gb/1952441‑1952512

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑