| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 315707 | NA (NA) | 108 (1.690) | 31/128 | 0.2 | 96.4% | coding (654/687 nt) | ykgA | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | W3110S.gb | 576911 = | 4 (0.060) | coding (76/498 nt) | ybcS | predicted lysozyme | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/315638‑315707‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > W3110S.gb/576911‑576979 CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGTATCAA < 1:692517/71‑1CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:904202/71‑1CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:3629645/71‑1CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:249430/71‑1CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:4483086/71‑1CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1808483/71‑1 AGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAA < 1:1202793/67‑1 CGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCC > 1:3364990/1‑70 CGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCC > 1:1543905/1‑70 CGGAACAATTTGAAAAAAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCC > 1:4540661/1‑70 GAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAAC > 1:2073360/1‑62 ACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGTTAGGATCAACTGGCCCAAGTG > 1:3942718/1‑71 CAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGG > 1:2722716/1‑71 ATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCTTATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGT < 1:3507106/70‑1 AAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATG < 1:1702255/71‑1 CAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTC < 1:2337198/71‑1 CAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAA > 1:861108/1‑63 ACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA < 1:3018021/71‑1 CCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA < 1:1178304/70‑1 TCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:3809310/58‑1 CGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTG > 1:822823/1‑71 CGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTG > 1:3142043/1‑71 AGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCA < 1:1861833/69‑1 GCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:110649/71‑1 CTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA > 1:4110074/1‑71 GTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAC > 1:4650232/1‑68 TGTCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:1778035/45‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:2713449/1‑71 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACC > 1:2425071/1‑70 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA < 1:1553910/66‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA < 1:290065/66‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA < 1:4247081/66‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA < 1:3622821/66‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA < 1:1313059/66‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA < 1:2039295/66‑1 TCCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTC > 1:4249555/1‑48 CCATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCA > 1:1947642/1‑70 CATATTACGTGGGTAGGATCAAGTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCAT > 1:1502288/1‑70 CATATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATA > 1:2919552/1‑71 TATTACTTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATAC > 1:603939/1‑70 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGg < 1:519435/39‑2 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATAC > 1:2240126/1‑70 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATA > 1:1615305/1‑69 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA > 1:4610837/1‑60 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTA < 1:4184319/60‑1 TATTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA < 1:701095/39‑1 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1208739/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:303741/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:4060631/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:3975522/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:3696551/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:247673/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1128116/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:2372043/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:2368981/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1946676/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1869175/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1517214/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:1228661/1‑69 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACA > 1:798274/1‑60 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTAC > 1:3884915/1‑59 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCA > 1:751816/1‑54 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:965951/1‑47 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAA > 1:1089324/1‑47 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTG > 1:1209941/1‑44 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA > 1:3894907/1‑37 TTACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGA > 1:3512816/1‑37 TTACGTCGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:902255/1‑69 ACGTGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACA > 1:2565616/1‑67 TGGGTAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGGGTCAGCTACATACCATACAAAGATAT < 1:1086085/71‑1 TAGGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTT < 1:2964450/71‑1 GGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTaga > 1:402766/1‑66 GGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGG < 1:2329959/71‑1 GGATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAT > 1:3715848/1‑65 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTT < 1:3993718/68‑1 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTT < 1:1288196/68‑1 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGAT < 1:562446/62‑1 GATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGAT < 1:274312/62‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:272116/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:2455349/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:4500444/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:3848076/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:1555692/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:1522355/71‑1 ATCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG < 1:702499/71‑1 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTtt < 1:3379213/71‑3 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGT < 1:460006/71‑1 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:3121058/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:944888/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:3362659/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:1263014/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:152644/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:1550536/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTG > 1:1590100/1‑70 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGG > 1:2289285/1‑68 TCAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATAT > 1:1207/1‑62 CAACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > 1:941867/1‑71 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA < 1:3094820/70‑1 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA < 1:313623/70‑1 AACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA < 1:4083694/70‑1 CCTCAGTCCGGAACAATTTGAAAACAAGAACCTCGCTTAGGCCTGTGTCCATATTACGTGGGTAGGATCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > W3110S.gb/315638‑315707‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACTGGCCCAAGTGGTAACGATGGTCTGGAAGGTGTCAGCTACATACCATACAAAGATATTGTTGGTGTA > W3110S.gb/576911‑576979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |