Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	848,718	A→G	intergenic (‑292/+112)	glnH ← / ← dps	glutamine transporter subunit/Fe‑binding and storage protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	848,718	0	A	G	100.0%	161.3 / NA	47	intergenic (‑292/+112)	glnH/dps	glutamine transporter subunit/Fe‑binding and storage protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (18/29);  total (18/29)

AAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGT  >  W3110S.gb/848651‑848778                                                                    |                                                             aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATTATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCa                                                           <  1:99123/71‑1 (MQ=255) aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCa                                                           <  1:3533260/71‑1 (MQ=255) aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCa                                                           <  1:3529648/71‑1 (MQ=255) aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCa                                                           <  1:307965/71‑1 (MQ=255) aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCa                                                           <  1:217384/71‑1 (MQ=255) aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCa                                                           <  1:2063477/71‑1 (MQ=255)     aaTCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAgatg                                                       <  1:3231547/71‑1 (MQ=255)      aTCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAgatg                                                       <  1:3410590/70‑1 (MQ=255)         tttATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAgatggatg                                                   >  1:4033752/1‑71 (MQ=255)           tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAtatggatg                                                   <  1:1610690/69‑1 (MQ=255)           tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAgatggatg                                                   <  1:2990683/69‑1 (MQ=255)           tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAgatggatg                                                   <  1:2714791/69‑1 (MQ=255)           tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAgatggat                                                    >  1:3876868/1‑68 (MQ=255)           tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCa                                                 >  1:1839867/1‑71 (MQ=255)           tATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCa                                                 >  1:4526287/1‑71 (MQ=255)               tAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTa                                              <  1:454540/70‑1 (MQ=255)                  cGATTGTGTGATGATGTTGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATa                                          <  1:2379990/71‑1 (MQ=255)                  cGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATa                                          <  1:153628/71‑1 (MQ=255)                  cGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATa                                          <  1:1789662/71‑1 (MQ=255)                  cGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATa                                          <  1:1780673/71‑1 (MQ=255)                          tgatgaTGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGtt                                  <  1:1462806/71‑1 (MQ=255)                           gatgatGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGtt                                  <  1:4624610/70‑1 (MQ=255)                            atgatgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTg                                 <  1:3246740/70‑1 (MQ=255)                            atgatgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:546180/71‑1 (MQ=255)                            atgatgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:776575/71‑1 (MQ=255)                            atgatgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:33679/71‑1 (MQ=255)                             tgatgTGTATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCAGTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:588512/70‑1 (MQ=255)                             tgatgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:819234/70‑1 (MQ=255)                             tgatgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:113493/70‑1 (MQ=255)                               atgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:120229/68‑1 (MQ=255)                               atgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                <  1:314320/68‑1 (MQ=255)                               atgTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAgg                              >  1:637154/1‑70 (MQ=255)                                  tgGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAg                               >  1:2099739/1‑66 (MQ=255)                                    gATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGt                                   >  1:1063711/1‑60 (MQ=255)                                    gATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCt                        >  1:1620125/1‑71 (MQ=255)                                      tACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAga                                                         >  1:2332238/1‑36 (MQ=255)                                       aCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGc                      >  1:289105/1‑70 (MQ=255)                                       aCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGc                      >  1:2403492/1‑70 (MQ=255)                                       aCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGc                      >  1:1672683/1‑70 (MQ=255)                                       aCAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGc                      >  1:1460467/1‑70 (MQ=255)                                          aaaaaTTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATaa                                         >  1:2199867/1‑48 (MQ=255)                                          aaaaaTTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAg                                        >  1:1031478/1‑49 (MQ=255)                                          aaaaaTTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGcaaaa                  >  1:1976158/1‑71 (MQ=255)                                             aaTTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGcaaaacaa               <  1:3013135/71‑1 (MQ=255)                                              aTTTACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGcaaaacaa               <  1:4671946/70‑1 (MQ=255)                                                 tACTTAATCAGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGa                                >  1:2555508/1‑50 (MQ=255)                                                          aGCTGGAGATGGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGt  >  1:4219053/1‑71 (MQ=255)                                                                    |                                                             AAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGT  >  W3110S.gb/848651‑848778

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑