Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,897,815	Δ1 bp	coding (260/1455 nt)	ygcU ←	predicted FAD containing dehydrogenase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,897,814	0	T	.	100.0%	127.3 / NA	30	coding (261/1455 nt)	ygcU	predicted FAD containing dehydrogenase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base . (0/30);  total (0/30)

CTACAACAGTTTCCAGCCCACCTTCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTTG  >  W3110S.gb/2897792‑2897856                       |                                           cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCTGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2212163/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1221014/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:918210/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:910524/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:903097/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:856107/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:810568/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:809245/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:808839/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:759426/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:742034/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:720235/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:549449/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:367123/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:25264/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:240295/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2391026/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2372482/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2328987/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2073416/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2005859/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1990411/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1856110/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1844787/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:174455/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1606151/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1459782/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:1019551/64‑1 (MQ=255) cTACAACAGTTTCCAGCCCACC‑CCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:2410592/64‑1 (MQ=255)           ttCCAGCCCACC‑TCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTtg  <  1:592705/54‑1 (MQ=255)                       |                                           CTACAACAGTTTCCAGCCCACCTTCGGTGGCGGAAGCACCGGTACGCGGCACACCGTTAATTTTG  >  W3110S.gb/2897792‑2897856

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑