Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,911,707	+G	coding (662/1455 nt)	xylB →	xylulokinase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,911,703	1	.	G	100.0%	91.6 / NA	25	W220G (TGG→GGG)	xylB	xylulokinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base G (0/25);  total (0/25)

CTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGT‑GGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTGG  >  W3110S.gb/3911677‑3911740                            |                                      cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1955545/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:89531/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:862312/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:716455/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:532473/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:464426/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:364449/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:292915/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:265571/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:248033/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:2177236/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:2141866/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:2092433/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1027455/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1839698/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:179995/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1546665/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1354351/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1325970/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1284129/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1220999/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1120972/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1065955/65‑1 (MQ=255) cTTTGTTACCTGAAGATGCGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1030364/65‑1 (MQ=255)                   cGAAAGCGTGGGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTgg  <  1:1640927/47‑1 (MQ=38)                            |                                      CTTTGTTACCTGAAGTTGCGAAAGCGT‑GGGGTATGGCGACGGTGCCAGTTGTCGCAGGCGGTGG  >  W3110S.gb/3911677‑3911740

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑