Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,235,640	+A	coding (655/1542 nt)	nhaB ←	sodium:proton antiporter

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,235,640	1	.	A	100.0%	94.0 / NA	29	V219L (GTG→TTG)	nhaB	sodium:proton antiporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/0);  new base A (29/0);  total (29/0)

TAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCAC‑CATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGAC  >  W3110S.gb/1235610‑1235673                                |                                  tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:2147541/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:988562/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:916523/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:909365/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:823402/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:463518/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:444207/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:2498903/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:2415658/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:2342630/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:111041/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:214495/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1394028/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1135432/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1165432/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1238922/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1250323/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1273596/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1297322/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:2005991/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1811161/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:1966246/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:2000110/1‑65 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGa   >  1:1869140/1‑64 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGa   >  1:2324218/1‑64 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGa   >  1:603235/1‑64 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGa   >  1:22365/1‑64 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGa   >  1:2190433/1‑64 (MQ=255) tAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCACACATGCTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGac  >  1:80146/1‑65 (MQ=255)                                |                                  TAGCGATGATCAGGTTCTGTGGTTCGCCCAC‑CATGGTCATTACGCCGCCTAATGCGGTGCCGAC  >  W3110S.gb/1235610‑1235673

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑