Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2147761	2147808	48	32 [0]	[0] 29	yegE	predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein

TTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGT  >  W3110S.gb/2147696‑2147760                                                                 | ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:2387718/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:996939/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:963568/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:901197/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:800220/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:784814/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:772699/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:770911/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:690350/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:682010/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:618803/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:510690/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:504039/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:32630/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:312128/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:2403899/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1009031/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:2343383/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:2189936/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:2185699/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:2070968/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1945986/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1861576/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1830670/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1822829/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1691661/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1644756/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1608666/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1487849/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1483905/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGt  >  1:1256657/1‑65 (MQ=255) ttGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGATACACGCATTATCAGt  >  1:2337504/1‑65 (MQ=255)                                                                 | TTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGCGTTTTATCGCTACACGCATTATCAGT  >  W3110S.gb/2147696‑2147760

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑