Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2161257	2161312	56	12 [0]	[0] 30	mdtC	multidrug efflux system, subunit C

ACTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGAT  >  W3110S.gb/2161192‑2161256                                                                 | aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTTAATATCAGCCGTTGat  <  1:1862664/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:1370148/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:1748132/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:1957470/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:2133913/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  >  1:2280901/1‑65 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:2336279/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:2359157/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  >  1:2465999/1‑65 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:633316/65‑1 (MQ=255) aCTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:698306/65‑1 (MQ=255)  cTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGat  <  1:1462387/64‑1 (MQ=255)                                                                 | ACTCACCGCTGGCAGATCCAGACCAATGATGAGCTAAAAACCGCCGCTGAATATCAGCCGTTGAT  >  W3110S.gb/2161192‑2161256

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑