Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2166211	2166254	44	30 [0]	[0] 18	baeS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BaeR

GCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACG  >  W3110S.gb/2166147‑2166210                                                                | gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTTCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:287039/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2436133/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:937090/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:879296/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:878396/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:857349/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:842336/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:720925/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:704683/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:690913/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:548522/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:493902/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2542952/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2536281/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2499694/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:1009904/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2399840/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2253213/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2223840/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2208734/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2181203/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2121755/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2116422/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:2038855/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:179697/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:1657898/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:1471712/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:1430663/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:120849/1‑64 (MQ=255) gCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACg  >  1:1129403/1‑64 (MQ=255)                                                                | GCCGGGCAGCGCGACAAAACGGTGCGCCTGACCTTTGCCGACAGTGCGCCAGGTGTCAGTGACG  >  W3110S.gb/2166147‑2166210

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑