Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2216860	2216865	6	22 [0]	[0] 34	yehU	predicted sensory kinase in two‑component system with YehT

ATCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAG  >  W3110S.gb/2216795‑2216859                                                                 | aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1897164/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:952273/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:254335/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:2337489/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:22894/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:226064/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:2192700/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:2175023/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:2142467/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1199704/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1757611/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1673747/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:151304/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1466588/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1466243/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1343101/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1264530/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1255390/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1240078/65‑1 (MQ=255) aTCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTAACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:1323683/65‑1 (MQ=255)  tCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:2323421/64‑1 (MQ=255)  tCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAg  <  1:872490/64‑1 (MQ=255)                                                                 | ATCACCGCTTTAATGGTGTTAAGCGCATTAAACAAAAAATGGGGATTCACCTGGGCGTGAAGCAG  >  W3110S.gb/2216795‑2216859

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑