Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2231905	2231992	88	28 [0]	[3] 15	yohH	conserved hypothetical protein

CAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATC  >  W3110S.gb/2231841‑2231904                                                                | cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1899142/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:802916/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:539206/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:506252/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:275032/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:255442/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:2516702/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:2476719/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:2197598/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:2130969/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:2066884/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1962773/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1009755/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1863688/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1797217/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1723509/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1617675/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1553740/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1320659/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1259248/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1248944/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1094382/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1068677/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1068127/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1057043/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCTGCATAACCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:2104935/64‑1 (MQ=255) cAGCCACCAGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:206558/64‑1 (MQ=255)           cATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATc  <  1:1310459/54‑1 (MQ=255)                                                                | CAGCCACCTGCATATCCGGTGCGTTCTGTAGTGCATTGTTAATTAAGGAAGTGAGTTGATTATC  >  W3110S.gb/2231841‑2231904

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑