Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2261445	2261457	13	33 [0]	[0] 30	yeiN	conserved hypothetical protein

TTTTTCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCA  >  W3110S.gb/2261380‑2261444                                                                 | tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:250698/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:982035/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:896331/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:818084/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:811506/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:726367/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:726033/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:723370/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:701471/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:607076/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:502429/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:404775/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:387079/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2516157/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1330829/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:180615/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1342860/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1540284/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1718292/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1767097/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2394438/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2042350/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:217164/65‑1 (MQ=255) tttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2338178/65‑1 (MQ=255)  ttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:599304/64‑1 (MQ=255)  ttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2275231/64‑1 (MQ=255)  ttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1518977/64‑1 (MQ=255)  ttttCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:865194/64‑1 (MQ=255)  ttttCCGGCGGCAAAAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2339706/64‑1 (MQ=255)       cggcggCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2508359/59‑1 (MQ=255)                      aaGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:2115963/44‑1 (MQ=255)                      aaGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1669986/44‑1 (MQ=255)                      aaGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCa  <  1:1471270/44‑1 (MQ=255)                                                                 | TTTTTCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCA  >  W3110S.gb/2261380‑2261444

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑