Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2317129	2317129	1	25 [0]	[0] 19	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GACCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTGG  >  W3110S.gb/2317064‑2317128                                                                 | gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:2384696/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:988861/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:959151/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:840755/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:799492/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:766018/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:613096/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:598653/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:502632/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:376810/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:292380/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:286218/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:2431680/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1051618/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:2361375/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:2229505/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:2127883/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1898205/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1895618/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1663810/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1576797/65‑1 (MQ=255) gacCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1275986/65‑1 (MQ=255)  acCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1959149/64‑1 (MQ=255)  acCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTgg  <  1:1212876/64‑1 (MQ=255)                             cAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGGCTACTATCTgg  <  1:1888641/37‑1 (MQ=255)                                                                 | GACCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTGG  >  W3110S.gb/2317064‑2317128

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑