Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2319260	2319298	39	23 [0]	[0] 15	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGCT  >  W3110S.gb/2319195‑2319259                                                                 | gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2178209/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:734694/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:651960/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:534206/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:293417/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2504590/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2339773/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2291684/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2269331/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2255319/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2232483/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2208218/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1100504/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:2132858/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1873287/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1859508/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1857787/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1738694/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:166870/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1469103/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1290938/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1253148/1‑65 (MQ=255) gTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGct  >  1:1225789/1‑65 (MQ=255)                                                                 | GTGACAGAATCGCCTCTGGGCGGAGATGAAAATGCGCAACTCCATGCCAGCGGCTATTATGCGCT  >  W3110S.gb/2319195‑2319259

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑