Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2326434	2326466	33	51 [0]	[2] 30	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

ATCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGCAT  >  W3110S.gb/2326373‑2326433                                                             | aTCCCTTTTTCACGACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1958410/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGGTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1402309/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTTGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:769975/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:392059/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1950852/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1993371/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1995476/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2046543/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2079261/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2081961/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2095658/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2235675/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2271130/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:2290061/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:254142/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1947956/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:393613/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:492565/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:494122/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:519949/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:60503/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:760511/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:775278/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:889679/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:982743/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1915606/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1054660/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:108593/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1132220/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1177636/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1184340/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1238625/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1252372/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1314519/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1415759/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1477202/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1521305/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1559654/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1607442/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1662938/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1664463/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:16665/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1690479/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1727434/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:188950/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1908937/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1911880/61‑1 (MQ=255) aTCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1016723/61‑1 (MQ=255) aTCACTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:396399/61‑1 (MQ=255)                  aaaGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:1280686/44‑1 (MQ=255)                          aGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGcat  <  1:351884/36‑1 (MQ=255)                                                             | ATCCCTTTTTCACCACCAAAGCCTCAGGAACCGGGCTTGGTCTGGCGTTAAGTCAACGCAT  >  W3110S.gb/2326373‑2326433

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑