Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2335290	2335305	16	30 [0]	[0] 30	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

CACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCA  >  W3110S.gb/2335226‑2335289                                                                | cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1967256/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:907092/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:906295/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:854110/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:789192/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:748528/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:419720/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:347642/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:2340623/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:2299954/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:2175424/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:20840/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1995208/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:130033/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1916650/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1860768/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1847719/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1827545/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:163119/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1623582/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1598118/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1591330/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1559721/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1553913/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1536858/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1463357/64‑1 (MQ=255) cACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1386172/64‑1 (MQ=255) cACCGCTAATAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:1800614/64‑1 (MQ=255)        aTTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGGTTTATCCCa  <  1:2233704/57‑1 (MQ=255)                         tgtgCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCa  <  1:555943/40‑1 (MQ=255)                                                                | CACCGCTATTAAGCAGCACAACCGTGTGCGCCAGCGGCTGATTGCTGTTTGCCGCTTTATCCCA  >  W3110S.gb/2335226‑2335289

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑