Missing coverage evidence...
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CACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAC  >  W3110S.gb/2403138‑2403202                                                                 | caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCTCCAc  <  1:2420575/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCTAc  <  1:324563/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2326079/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:845181/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:79061/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:736540/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:61080/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:576467/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:268432/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2543354/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2477196/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:247519/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2435884/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2426860/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2411578/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1063575/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:217300/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:2149332/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1976907/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1966839/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1877621/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1842442/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1814038/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:178159/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1668871/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1624925/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1622419/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1377441/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1372518/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1071044/65‑1 (MQ=255) caccaccacCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:1068214/65‑1 (MQ=255)                             tCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAc  <  1:45576/37‑1 (MQ=255)                                                                 | CACCACCACCGCGTCGGCGCGTCCGGTTTCCAGTTCGGTTAACGCTTCTTCAAGCGAACCGCCAC  >  W3110S.gb/2403138‑2403202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑