Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2440727	2440774	48	37 [0]	[0] 6	truA	pseudouridylate synthase I

CGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAG  >  W3110S.gb/2440662‑2440726                                                                 | cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1968349/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:928986/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:923903/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:711815/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:697652/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:562937/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:2370124/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:2324011/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:2271277/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:2260285/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:2105528/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1970639/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1108672/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1962332/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1947415/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1791655/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:11189/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1169951/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1170990/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1195644/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1223898/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1278541/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1402107/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1404949/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1423396/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:148619/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1713862/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1769234/65‑1 (MQ=255) cGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1805639/65‑1 (MQ=255)  gTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:2262470/64‑1 (MQ=255)  gTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:480822/64‑1 (MQ=255)  gTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:55047/64‑1 (MQ=255)  gTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:1458708/64‑1 (MQ=255)  gTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:736253/64‑1 (MQ=255)  gTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:802528/64‑1 (MQ=255)  cgtaaaaTGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAg  <  1:751316/61‑1 (MQ=255)                       aCTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGTTGATTGTAGATGATGTAg  <  1:680077/43‑1 (MQ=255)                                                                 | CGTAAAAATGGGTTACCCCTTTACTCAGTACCGCCGGGCGCAGCCGATGATTGTAGATGATGTAG  >  W3110S.gb/2440662‑2440726

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑