Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2457729	2457751	23	36 [0]	[0] 23	yfcS	predicted periplasmic pilus chaperone

TAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAG  >  W3110S.gb/2457665‑2457728                                                                | tAAATATCAAACTGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:926593/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1538748/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:876759/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:86192/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:857639/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:788731/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:730203/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:727110/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:719693/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:637866/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:522298/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:442976/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:356915/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:314648/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2486422/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2348808/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1848783/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1525229/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1576314/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1609664/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1636277/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1654127/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1656087/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1816993/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2286546/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1954538/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1990137/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2081149/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2133361/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2222528/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2249170/64‑1 (MQ=255) tAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTAAAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:574914/64‑1 (MQ=255)  aaaTATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:2426709/63‑1 (MQ=255)                 aCGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:1680377/48‑1 (MQ=255)                    aTCTGTCGTTACAGACGCCAGGGCAGACATACTGGTAGCGCTAAg  <  1:859885/45‑1 (MQ=255)                        ggCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAg  <  1:267756/41‑1 (MQ=255)                                                                | TAAATATCAAACGGGTACGATCTGGCGTTACAGACGCCAGGGCAGACAAACTGGTAGCGCTAAG  >  W3110S.gb/2457665‑2457728

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑