Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	2523281	2523547	267	31 [0]	[0] 39	[alaX]	[alaX]

GGTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGA  >  W3110S.gb/2523216‑2523280                                                                 | ggTGAGCGTAAACTCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGTTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:786991/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTTAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1414765/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGTATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:40922/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:2326565/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:92489/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:819117/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:818667/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:711965/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:672985/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:630892/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:569245/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:429117/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:252263/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:2392323/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1056750/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:2307020/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:216745/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1986266/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1939222/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:185720/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1804067/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:179661/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1452836/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1405063/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1392512/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1198888/65‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1183002/65‑1 (MQ=255)  gTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:1856495/64‑1 (MQ=255)   tGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:358655/63‑1 (MQ=255)                  gtgtGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:438869/48‑1 (MQ=255)                     tgAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGa  <  1:447918/45‑1 (MQ=255)                                                                 | GGTGAGCGTAAACGCTAGTGTGAATATCTTGATATTTTTTATCAGGTTATGCTCCACAAACATGA  >  W3110S.gb/2523216‑2523280

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑