Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2539751	2539831	81	28 [0]	[0] 16	ptsI	PEP‑protein phosphotransferase of PTS system

ACGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATGCTGCT  >  W3110S.gb/2539686‑2539750                                                                 | aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:2061076/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:983482/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:936670/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:898144/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:685502/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:654307/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:632379/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:605766/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:473144/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:416375/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:400190/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:306372/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:2354875/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1057430/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1982204/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1942496/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1903967/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1781470/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1676390/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1513962/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1326756/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1315163/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1292315/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1265223/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1252410/65‑1 (MQ=255) aCGAAAGCTGGGGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:1556514/65‑1 (MQ=255)   gAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:2003261/63‑1 (MQ=255)   gAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATgctgct  <  1:443394/63‑1 (MQ=255)                                                                 | ACGAAAGCTGGTGAAACGTTCGGTGAAGAAAAAGAAGCCATCTTTGAAGGGCATATTATGCTGCT  >  W3110S.gb/2539686‑2539750

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑