Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2545669	2545714	46	24 [0]	[1] 5	cysA	sulfate/thiosulfate transporter subunit

GTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGCTTCTT  >  W3110S.gb/2545604‑2545668                                                                 | gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:2377957/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:968351/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:73556/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:679180/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:643902/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:403319/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:394992/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:328809/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:317626/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:267708/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1147463/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:2188726/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:2133332/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:2040241/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1918559/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1779995/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1739404/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1717369/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1620396/65‑1 (MQ=255) gTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:1244687/65‑1 (MQ=255)  tCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:138617/64‑1 (MQ=255)  tCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:76891/64‑1 (MQ=255)  tCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:824003/64‑1 (MQ=255)       cTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGcttctt  <  1:2189017/59‑1 (MQ=255)                                                                 | GTCAGCCTGTTCAATATTGCCCTGGCTCATCACAACTACACGATCAGCTACTTCGGTCGCTTCTT  >  W3110S.gb/2545604‑2545668

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑