Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2687746	2687757	12	29 [0]	[0] 5	yfhG	conserved hypothetical protein

TGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCG  >  W3110S.gb/2687681‑2687745                                                                 | tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGGCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:724168/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:410055/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:99372/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:933784/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:729410/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:677358/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:648310/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:633710/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:562693/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:55958/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:515236/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:425310/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:424313/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1132218/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:247315/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:2433999/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:2387977/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:2190913/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:2120313/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1911122/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1823971/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1757517/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1727122/65‑1 (MQ=255) tGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1355663/65‑1 (MQ=255)  ggCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:412236/64‑1 (MQ=255)  ggCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:2456383/64‑1 (MQ=255)  ggCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:1468915/64‑1 (MQ=255)  ggCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:139486/64‑1 (MQ=255)                    ggagttgcagCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCg  <  1:954971/44‑1 (MQ=255)                                                                 | TGGCGCTCTTCCGCCAGTTGCAGTTGCAGCGCCTGACCATCGCGCCAGAGTTGATACAGTGGGCG  >  W3110S.gb/2687681‑2687745

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑