Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2740701	2740769	69	28 [0]	[0] 40	yfiR	hypothetical protein

GTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCTT  >  W3110S.gb/2740636‑2740700                                                                 | gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:183401/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2457447/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2413775/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2525394/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:231738/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2233502/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2189279/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2143469/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:449026/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2026350/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1997500/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1594598/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1588843/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:158376/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:56362/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1259355/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:790743/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:12240/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:991102/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1102681/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1082850/65‑1 (MQ=255) gTTTCCGGTAATGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1096198/65‑1 (MQ=255)  tttCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:271024/64‑1 (MQ=255)  tttCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1215353/64‑1 (MQ=255)        gTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1252376/58‑1 (MQ=255)          aTTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2051119/56‑1 (MQ=255)            tGTCAGTTCCACCCGCTGGCCTGCGCTATCCGGTCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:2395488/54‑1 (MQ=255)                       cccGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCtt  <  1:1571635/43‑1 (MQ=255)                                                                 | GTTTCCGGTATTGTCAGTTACACCCGCTGGCCTGCGCTATCAGGGCCACCAAAGTTATGTATCTT  >  W3110S.gb/2740636‑2740700

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑