Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2741092	2741120	29	9 [0]	[0] 40	yfiN	predicted diguanylate cyclase

CACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCATT  >  W3110S.gb/2741027‑2741091                                                                 | cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:134227/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:1452745/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:1581469/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:2196885/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:2429007/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:2496501/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:357454/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:465991/1‑65 (MQ=255) cACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCAtt  >  1:995696/1‑65 (MQ=255)                                                                 | CACGGAAGAAAAATGATGGATAACGATAATTCTCTTAATAAGCGCCCCACGTTTAAAAGAGCATT  >  W3110S.gb/2741027‑2741091

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑